乌市医学院是医科大学的分校，医科大学在乌鲁木齐市有两个分校，一个是雪莲山校区，位于维吾尔自治区乌鲁木齐市水磨沟区尚德北路567号。另外是新医路校区，位于维吾尔自治区乌鲁木齐市新医路393号。
医科大学位于乌鲁木齐，是唯一一所建制的医学院校，为省部委共建高校。
以及卓越医生教育培养计划项目试点高校、中国奖学金来华留学生接收院校、自治区首批来疆留学高校示范基地。
医科大学目前有雪莲山校区、新医路校区、鲤鱼山校区、明园校区、仓房沟校区，总5个校区。
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