民事纠纷调解不会有案底。因为案底是犯罪的人才会有的，是犯罪记录。民事纠纷，由负责管辖并裁决，会对民事纠纷案件存档。所以，民事纠纷案件，是会有案件记录。但不是案底。
人民受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用法律规定。
我国没有民事拘留这一说法，假如是行政拘留的话，是不会留案底的。
案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至门与相关国家机关。行政拘留不属于刑事处罚。
【法律依据】：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条
犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。
犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
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