在地铁车厢里查身份证是允许的。
这是的职责和权力，应当配合的查证行为。如果不配合，可能会被处罚的。证件申领和制发的基本程序是，公民应当自年满16周岁之日起三个月内，到常住户口所在地的机关办理申领手续，要交验居民户口簿、本人照片，填写《居民身份证申领登记表》交纳证件工本费。未满十六周岁的公民，自愿申请领取居民身份证的，由监护人代为申请领取居民身份证。机关在对公民申报材料与本人户口登记项目内容核对无误后，将信息传输报送上一级机关制证。
在前往时，应携带居民户口簿、两张本人彩色相片和原申领的第一代居民身份证。在办理手续时，要填写《居民身份证申领登记表》和进行身份证指纹收集，协助工作人员准确核身份证登记项目，并交纳证件工本费。注意的是流动人口录指纹要回户口所在地办理。自助服务终端开通，实现的功能有户籍查询、办理进度查询、户籍证明打印和身份证的补办、丢失注销。还可以办理注销证明和关系证明。
《中华人民共和国居民身份证法》第十五条 人民依法执行职务，遇有下列情形之一的，经出示执法证件，可以查验居民身份证：
（一）对有违法犯罪嫌疑的人员，需要查明身份的；
（二）依法实施现场管制时，需要查明有关人员身份的；
（三）发生严重危害社会治安突发事件时，需要查明现场有关人员身份的；
（四）在火车站、长途汽车站、港口、码头、机场或者在重大活动期间设区的市级规定的场所，需要查明有关人员身份的；
（五）法律规定需要查明身份的其他情形。
