两者包含关系不同。耕地包含基本农田。基本农田只是耕地的其中一部分，而且主要是高产优质的那部分耕地，并不是所有的耕地都是基本农田。一般而言，只有那些划入基本农田保护区内的耕地，才视为基本农田。基本农田是指根据一定时期人口和国民经济对农产品的需求以及对建设用地的预测而确定的长期不得占用的和基本农田保护区规划期内不得占用的耕地。保护程度不同。基本农田是属于重点保护的耕地种类，非特别情况不得占用；耕地中的一般农田没有基本农田的保护严格，不属重点保护种类。
一、哪些耕地应当划为永久基本农田
下列耕地应当根据土地利用总体规划划为永久基本农田，实行严格保护：(一)经农业农村主管部门或者县级以上地方批准确定的粮、棉、油、糖等重要农产品生产基地内的耕地；(二)有良好的水利与水土保持设施的耕地，正在实施改造计划以及可以改造的中、低产田和已建成的高标准农田；(三)蔬菜生产基地；(四)农业科研、教学试验田；(五)规定应当划为永久基本农田的其他耕地。各省、自治区、直辖市划定的永久基本农田一般应当占本行政区域内耕地的百分之八十以上，具体比例由根据各省、自治区、直辖市耕地实际情况规定。
二、永久基本农田包括哪些？
永久基本农田包括：
1、经农业农村主管部门或者县级以上地方批准确定的粮、棉、油、糖等重要农产品生产基地内的耕地；
2、有良好的水利与水土保持设施的耕地，正在实施改造计划以及可以改造的中、低产田和已建成的高标准农田；
3、蔬菜生产基地；
4、农业科研、教学试验田；
5、规定应当划为永久基本农田的其他耕地。
【本文关联的相关法律依据】
《基本农田保护条例(1998)》中的第二条：国家实行基本农田保护制度。本条例所称基本农田，是指按照一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求，依据土地利用总体规划确定的不得占用的耕地。本条例所称基本农田保护区，是指为对基本农田实行特殊保护而依据土地利用总体规划和依照法定程序确定的特定保护区域。
