法律分析：个税手续费是指发放给具体办税人的手续费的意思。个人所得税代征手续费，指代扣代缴个人所得税的公司，可以向当地的地方税务局申请，由税务机关付给代征税额2%的手续费，这是因为公司代扣代缴个人所得税，不属于公司的日常工作，而是为税务局工作，因此应当适当的予以报酬。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》 第十七条 对扣缴义务人按照所扣缴的税款，付给百分之二的手续费。
《中华人民共和国个人所得税法实施条例》
第三十三条 税务机关按照个人所得税法第十七条的规定付给扣缴义务人手续费，应当填开退还书缴义务人凭退还书，按照国库管理有关规定办理退库手续。
《财政部 税务总局 人民银行关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》
第四条 “三代”税款手续费按年据实清算。代扣、代收扣缴义务人和代征人应于每年3月30日前，向税务机关提交上一年度“三代”税款手续费申请相关资料，因“三代”单位或个人自身原因，未及时提交申请的，视为自动放弃上一年度“三代”税款手续费。
