法律分析：户籍转移时新农村合作医疗并不会一并转移。
户籍转移手续由机关操作、处理，只是针对当时人户籍关系的转移；新农村合作医疗是在当地社保机构的参保，机关的户籍管理并不直接掌握这一信息，且不属于其业务范围。因此新农村合作医疗并不会随同当事人户籍关系的转移而转移，需要时当事人应到当地社保机构办理转移手续。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
