保税仓库货物报关流程如下：
进出境报关：
1、保税区与境外之间进出境自用货物报关制，填写进出口报关单；
2、保税区与境外之间进出境非自用货物加工出口、转口、展示、仓储备案制，填写进出境货物备案清单。
进出区报关：
1、进区，报出口，填写出口报关单，要有加工贸易登记手册或加工贸易电子账册，提供有关许可证件，不签发出口货物报关单退税证明；
2、出区，报进口，按实际流向办理进口海关手续。
投资设备进出区向海关备案，进区不填写报关单，免缴纳关税，不签发出口货物报关单退税证明联。设备从国外进口已征收进口税的，不退进口税。设备退出区外的，不填写报关单，但需向海关销案。
保税仓库的作用：
这是一国海关设置的或经海关批准注册、受海关监督和管理的可以较长时间存储商品的区域。保税区能便利转口贸易，增加有关费用的收入。运入保税区的货物可以进行储存、改装、分类、混合、展览，以及加工制造，但必须处于海关监管范围内。外国商品存入保税区，不必缴纳进口关税，尚可自由出口，只需交纳存储费和少量费用，但如果要进入关境则需交纳关税。
法律依据：《中华人民共和国海关法》第三条
保税仓库按照使用对象不同分为公用型保税仓库、自用型保税仓库。
公用型保税仓库由主营仓储业务的中国境内企业法人经营，专门向社会提供保税仓储服务。
自用型保税仓库由特定的中国境内企业法人经营，仅存储供本企业自用的保税货物。
