免于刑事处罚案底不会消除。除了判决无罪之外的刑事判决结果都是会留下案底的，免于刑事处罚只是免除刑事处罚而已，并不代表无罪。
所以，只要是犯罪，就会留下案底。消除档案中刑事责任的记录（所谓案底）基本是不可能的，只有在个别地方有一些相关规定和司法解释，认为可以对未成年犯罪的行为人积极悔改的可以在档案中封存犯罪记录。
一、被判免予刑事处罚案底能取消吗?
刑事处罚的案底是不能取消的。免予刑事处罚指因某些原因犯下罪行，需要刑事处罚，但因为自首或其他情节，导致不用接受刑事处罚。那么免于刑事处罚会有案底吗？免于刑事处罚也会有相关记录的，同时机关内部会做为资料保存，是有案底的。免予刑事处罚不等于没犯罪,只是因为犯罪情节轻微或者其他情节才免予处罚。它不同于无罪释放。所以，会有犯罪纪录。
二、醉驾前科能消除吗
醉驾入刑属于犯罪行为，被判处拘役的犯罪案底无法消除。刑事处罚进入档案留下案底，不可以消除。醉驾被查后要看收到的处分是行政处罚还是刑事处罚，行政处罚会有行政处罚的判决书，没有案底。而如果构成交通肇事罪，收到刑事处罚，会有案底在保留。如果醉驾收到刑事处罚，案底不可以消除，会被保留，但是档案对外保密。
【本文关联的相关法律依据】
《刑法》第一百条，依法受过刑事处罚的人，在入伍、就业的时候，应当如实向有关单位报告自己曾受过刑事处罚，不得隐瞒。
犯罪的时候不满十八周岁被判处五年有期徒刑以下刑罚的人，免除前款规定的报告义务。
